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《基因组卵白质组与生物信息学报》2009年第3期内容推介

2009年第3期《基因组卵白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics)重点关注了几种致病微生物的相关研究。其中,我所胡松年研究组的张国强等运用新要领对结核杆菌(Mycobacterium tuberculosis)卵白进行筛选和检测以区分结核病人和卡介苗接种者,取得了良好效果。四川大学鲍锦库研究组凭据水平基因转移的理论运用生物信息学要领对稻瘟菌(Magnaporthe grisea)的熏染机制进行了剖析,并发明了某些可能的水平转移基因。伊朗Shiraz大学的Hassan Mohabatkar等对利什曼原虫(Leishmania major)10半胱氨酸卵白酶序列做了生物信息学剖析,为疫苗研发提供了有益资助。印度的K. Natarajaseenivasan等用系统爆发要领剖析了钩端螺旋体(Leptospira)外膜脂卵白编码基因ompL1, lipL32lipL41的抗原变异性,发明了某些特定差别,对相关疫苗的研发将起到重要作用。

别的,本期还宣布了我所基因组科学与信息重点实验室的王大鹏等对替换率变量影响非同义替换率(Ka)和同义替换率(Ks)盘算的研究结果,希腊的Pantelis G. Bagos等对膜卵白结构预测的研究,以及两款生物信息学的应用软件。

本期的网上全文可以在Elsevier出书集团的ScienceDirect数据库(www.sciencedirect.com/science/journal/16720229)中浏览下载,同时接待各人积极引用、投稿。

 

附:本期目录

Articles

In silico analysis of the potential infection mechanisms of Magnaporthe grisea from horizontal gene transfer hypothesis                   P77-86

 

Computational analysis of cysteine proteases (clan CA, family C1) of Leishmania major to find potential epitopic regions                  P87-95

 

Evolutionary implication of outer membrane lipoprotein-encoding genes ompL1, lipL32 and lipL41 of pathogenic Leptospira species          P96-106

 

Screening and assessing 11 Mycobacterium tuberculosis proteins as potential serodiagnostical markers for discriminating TB patients from BCG vaccinees

P107-115

 

How do variable substitution rates influence Ka and Ks calculations?    P116-127

 

How many 3D structures do we need to train a predictor?         P128-137

 

Application Notes

PBOND: web server for the prediction of proline and non-proline cis/trans isomerization                          P138-142

 

3D Genome Tuner: compare multiple circular genomes in a 3D context   P143-146
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