基因组所加入国际基因组ENCODE计划取得系列研究结果
近日，国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的人类基因组剖析数据，并以30余篇论文的形式同时宣布在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上 。ENCODE被认为是继“人类基因组计划”之后国际科学界在生命科学研究领域取得的又一重大进展 。以往研究者常关注与编码卵白质相关的基因，但它们只占整个基因组的约2％ 。ENCODE研究团队完成了解析基因组非编码区域的事情，人类基因组中约80%的区域都被确定拥有某种确定的功效 。ENCODE项目从近期看有利于测序工业，基因组会成为更热的研究偏向，而从久远来看，其影响深远，对疾病诊断、药物研发等都将具有积极的推行动用，新增市场价值当以万亿美元盘算 。
始于2009年的基因组所偏向东研究员项目组利用与美国华盛顿大学基因组学系建立多年的相助关系，选派该组青年科技主干渠鸿竹博士，通过多次会见交流和客座研究等形式，与ENCODE计划卖力人之一、美国国立卫生研究院西北注释表观基因组绘图中(Northwest Reference Epigenome Mapping Center，NIH)主任John A. Stamatoyannopoulis博士所领导实验室研究人员一起事情，迄今为止已经配合宣布了三篇标记性的ENCODE文章 。
在渠鸿竹博士作为配合第一作者、基因组所第二作者单位的Genome Research所宣布文章中，渠鸿竹博士主要卖力生物信息学剖析事情，将重要转录因子与染色质DNA之间的相互作用和DNA甲基化这两个差别条理的表观基因组学数据进行统合研究，关于CTCF在染色质DNA的结合效率和DNA甲基化之间的相互关系进行研究并取得了立异进展 。在基因组所作为第二作者单位的Science所宣布文章中，渠鸿竹博士作为生物信息学团队的主要成员，主要卖力将全基因组DNase I图谱等表观基因组数据与已有的GWAS SNPs数据结合，首次在表观基因组水平上开展GWAS研究事情，为研究庞大性疾病的遗传机制提供了全新的研究战略 。
在9月5日Nature在线宣布的文章中，渠鸿竹博士与Stamatoyannopoulis博士实验室研究人员所在实验室的科研人员利用新一代高通量测序平台完成了125种人类细胞和组织的DNase I 高敏感微点(DHSs)的全基因组图谱，首次展示了至今为止最为详尽的人类基因组调控DNA图谱，揭示了染色质可及性、转录、DNA甲基化、序列特异性转录因子结合谱式等差别条理的表观遗传调控因素之间庞大的相互关系 。本项研究关于彻底读懂、读通人类基因组这本“天书”具有重要的意义 。
基因组所通过“引进来、走出去”等灵活多样的相助培养机制，与美国芝加哥大学、美国华盛顿大学、美国西南医学中心大学、等国际顶尖研究机构坚持了密切的交流与相助关系，积极加入重大科学研究计划，实时掌握世界前沿科学的生长脉络，有效提升研究所的学术职位和国际声誉，努力培养青年科技主干人才快速成才 。已往几年的乐成经验证明：基因组所在人才步队建设方面已经进行了了有益的探索，并且获得了令人瞩目的结果，为今后的科技立异争优事情的可连续生长涤讪了坚实的基础 。
文章链接：
http://www.nature.com/nature/journal/v489/n7414/full/nature11232.html
图：利用DNase I和H3K4me3数据研究未知启动子以及转录偏向
