进化树是反应物种之间进化关系的常用可视化工具,用来体现差别物种亲缘关系的远近。为便当研究人员快速解读进化树中所包括的信息,基因组科学与信息重点实验室胡松年组于2012年开发了进化树可视化和注释工具Evolview。该软件支持多种常用进化树花样(如newick, nexus, nhx等),并支持以多种方法对进化树进行注释,好比将注释信息显示为“饼图”、“条形图”等。
近期,在Evolview原有注释功效基础上,该团队添加了7种新的注释,包括点阵图、热图、分组标签等。别的,Evolview还提供5个个性化的展示案例,每个展示案例综合利用了多种新的注释工具对进化树进行解读,便当研究人员熟悉新的注释工具,付与进化树更多的生物学意义。该结果于4月30日在Nucleic Acids Research 杂志在线宣布,基因组科学与信息重点实验室的胡松年研究员与客座研究员陈卫华博士是该篇文章的配合通讯作者。
自2012年宣布以来,Evolview受到众多用户的接待。目前为止,共有2500个用户上传了12000个进化树和8600个注释文件,月活跃用户、上传数据量和引用次数都在连续增加。目前每月约莫有200名活跃用户,上传550个进化树和450个注释文件。该工具为科研人员进行进化生物学、流行病学以及物种分类研究提供了极大便当。
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Evolview新增的7种注释工具示意图